Upravne naloge in inšpekcijsko nadzorstvo na področju veterinarstva opravlja Veterinarska uprava Republike Slovenije, ki je organ v sestavi Ministrstva za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano. Med najpomembnejše upravne naloge spadajo:

• skrb za izvajanje predpisov o veterinarstvu in zagotavIjanje izobraževanja na tem področju;
• spremljanje gibanja živalskih kužnih bolezni v državi in v tujini in obveščanje vseh zainteresiranih v Sloveniji in tujini;
• sprejemanje programov, usklajevanje dela in določanje ukrepov za izvajanje programov obvladovanja in preprečevanja širjenja živalskih kužnih bolezni in epidemij;
• zagotavljane izvajanja in organizacija monitoringa nad ostanki škodljivih snovi v živilih;
• zagotavljanje izvajanja in organizacija monitoringa nad ostanki škodljivih snovi v živalih in krmi;
• možnost prepovedi uporabe določenih škodljivih snovi in zdravil;
• zagotavljanje letne analize rezultatov monitoringa škodljivih snovi v živilih, izdelave ocene tveganja glede teh ostankov v živilih in priprave letnega poročila;
• registriranje in vodenje registra prevoznikov živali;
Poleg upravnih nalog opravlja Veterinarska uprava Republike Slovenije tudi inšpekcijsko nadzorstvo nad izvajanjem zakonov, drugih predpisov in mednarodnih pogodb, ki se nanašajo na:

• veterinarstvo v Republiki Sloveniji;
• varstvo pred kužnimi boleznimi živali;
• zagotavljanje varstva prebivalstva pred nalezljivimi boleznimi glede obveznosti veterinarske službe pri preprečevanju in zatiranju zoonoz;
• uporabo zdravil, ki se uporabljajo v veterinarski medicini;
• zdravstveno ustreznost in zdravstveno nadzorstvo nad živili;
• higieno proizvodnje in prometa z mlekom;
• veterinarske ukrepe v živinoreji glede zagotavljanja nemotene reprodukcije živali, glede ukrepov za preprečevanje in zatiranje jalovosti, glede zdravja živali in zdravstvene sposobnosti za razmnoževanje, prometa in skladiščenja živalskega semena, jajčnih celic, zarodkov, iker, valilnih jajc in čebeljih matic, glede pridobivanja in priprave živalskega semena, jajčnih celic in zarodkov ter osemenjevanja in zdravstvene ustreznosti živalskega semena, jajčnih celic in zarodkov;
• ukrepe za varstvo živali pred škodljivim delovanjem ionizirajočih sevanj;

• zaščito živali pred mučenjem;
• mednarodni promet;
• zdravstveno ustreznost krme in vode za napajanje.
V ta namen ima Veterinarska uprava Republike Slovenije organiziranih 10 območnih uradov notranje inšpekcije  in 6 mejnih kontrolnih točk.